蛋白样本制备、免疫组化、双向电泳、蓝色温和胶电泳系统分离蛋白质复合体、图像分析、胶内酶切、蛋白质鉴定、数据库查询与结果分析、免疫印迹及磷酸化蛋白质检测
北京蛋白质组研究中心功能蛋白质组研究技术平台可承接单项的蛋白质组学技术服务, 同时平台也开展规模化、高通量的蛋白质组学委托科研服务。
iTRAQ同位素标记相对定量和绝对定量分析
iTRAQ 采用液质联用的方法高通量地检测多组别间的蛋白质表达差异。蛋白质酶切成多肽后，用iTRAQ同位素试剂标记多肽N末端或赖氨酸侧链基团。标记后的多肽经过液相色谱分离，进行一级和二级质谱分析，在
蛋白质组学Label Free分析服务
蛋白质非标记定量技术（label-free）是通过液质联用技术对蛋白质酶解肽段进行质谱分析，无需使用昂贵的稳定同位素标签做内部标准，即可对肽段对应的蛋白质进行相对定量。
2D + MALDI-TOF/TOF蛋白胶点鉴定服务
利用MALDI-TOF/TOF技术对双向电泳中指定的胶点（考染、银染或DIGE）或单一纯化蛋白样品进行质谱鉴定。
蛋白质修饰底物与PTM催化酶的底物高通量鉴定
iTRAQ/TMT蛋白组定量分析 SILAC蛋白组定量分析 Label Free非标定量分析 半定量分析（spectral count） 鸟枪法蛋白全谱分析 2D蛋白胶点鉴定 单一蛋白高覆盖度分析
定量蛋白质组学——TMT
TMT是开发的一种多肽体外标记技术。通过对不同样品中的肽段采用不同通道的TMT 试剂进行标记，然后进行LC-MS/MS 分析，通过TMT 标记信号的强度值实现样本蛋白组之间的相对定量。